Vatnahalsen ligger i Aurland Kommune i Sogn og Fjordane Fylke.

Hotellet troner på toppen av Flåmsdalen, 820 m.o.h. All transport til og fra Vatnahalsen foregår med tog (det er ikke mulig å kjøre bil hit). Det innebærer stillhet og ro blant mektige fjell. Bergensbanen fra Oslo eller Bergen bringer deg til Myrdal stasjon, herfra kan du ta en kort tur med Flåmsbana til Vatnahalsen stasjon, ca. 50 meter fra hotellet. Du kan også kjøre til Flåm og ta Flåmsbana opp til hotellet. Dette er en av verdens mest spektakulære togreiser, med panoramautsikt over et storslått norsk fjell- og fjordlandskap.

Om sommeren kan du ta deg hit på sykkel eller til fots langs den populære Rallarvegen fra Haugastøl eller Finse. Det er også mulig å gå fra Myrdal stasjon til Vatnahalsen i sommerhalvåret.